Fonden for økologisk landbrug har hjemmel i landbrugsstøtteloven, som fastlægger de overordnede bestemmelser for fondens virke.

Fondens formål er at styrke udviklingsmuligheder og konkurrenceevne for økologisk landbrug.

Med henblik herpå yder fonden tilskud til projekter under følgende hovedformål:
- afsætningsfremme
- forskning og forsøg
- produktudvikling
- rådgivning
- uddannelse
- sygdomsforebyggelse
- sygdomsbekæmpelse
- dyrevelfærd
- kontrol
- medfinansiering af EU-programmer

Fonden ledes af en bestyrelse, som er udpeget af fødevareministeren. I bestyrelsen sidder 8 repræsentanter for jordbrugserhvervet og 4 repræsentanter for offentlige interesser.